Гипотезу о происхождении жизни на Земле из “мира РНК” многие ведущие ученые планеты считают сегодня одной из основополагающих. В основе процесса возникновения и развития жизни лежит передача наследственной информации с учетом произошедших изменений. А необходимые для синтеза биологических макромолекул химические вещества могли попасть на нашу планету из космических просторов с метеоритными дождями. Неясным в свете теории «мира РНК» до последнего времени оставался вопрос о способе синтеза пуринов — одного из ключевых компонентов ДНК, РНК и энергетического метаболизма любой клетки. Ученым Мюнхенского университета Людвига–Максимилиана удалось синтезировать пурины в лабораторных условиях, которые были приближены к тем, которые существовали на Земле «в начале времен» и при этом обойтись без участия сложных ферментов.
Рубрика «РНК» - 2
Биологи нашли в ДНК человека полноценный древний ретровирус
2016-03-25 в 14:51, admin, рубрики: вирусы, днк, Здоровье гика, Научно-популярное, ретровирусы, РНК 
Генетики из Университета Тафтса и медицинской школы при Мичиганском университете при изучении геномов 2500 людей нашли девятнадцать ранее незамеченных фрагментов ДНК, оставленных в людях ретровирусами. А в 50 из исследуемых геномов найден ретровирус целиком. Это второй вирус, найденный в геноме человека, сохранившийся там полностью.
Ряд вирусов обладает способностью внедряться в геном человека и становиться его собственными генами. В первую очередь это относится к так называемым ретровирусам, названных так по своему образу жизни. Исходно геном этих вирусов представляет собой РНК. Но, попав в клетку, вирус на своей РНК строит ДНК-копию. После этого ДНК-копия вируса встраивается в геном клетки.
Встраиваемую в геном клеток человека ДНК-копию вируса называют провирусом. Затем на провирусе синтезируются вирусные РНК, на базе которых образуются новые вирусные частицы. Так ведет себя, например, хорошо известный ретровирус, получивший название вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), когда он инфицирует клетки крови.
Читать полностью »
Раковые клетки теоретически можно перепрограммировать на нормальную работу
2015-08-26 в 17:05, admin, рубрики: PLEKHA7, агрегация клеток, биологический код, Биотехнологии, Здоровье гика, кадгерин, катенин, лечение рака, микроРНК, Научно-популярное, программирование клеток, рак, РНК, метки: агрегация клеток 
Схема агрегации клеток — слипания их в многоклеточное образование. Иллюстрация: Википедия
Исследователи из клиники Майо — одного из крупнейших в мире частных медицинских центров — нашли теоретически возможный способ «перепрограммирования» раковых клеток, чтобы они вернулись в нормальное состояние. Научная статья опубликована в журнале Nature Cell Biology (pdf).
Открытие представляет собой «неожиданно найденный новый биологический механизм, который обеспечивает код, программу для отключения рака», — поясняет доктор Панос Анастасиадис (Panos Anastasiadis, Ph.D.), ведущий автор научной работы, директор отделения биологии рака в клинике Майо.
Читать полностью »
Осаждение ДНК на кухне
2015-04-27 в 23:34, admin, рубрики: diy или сделай сам, биология, Биотехнологии, днк, Научно-популярное, РНК 
Привет Geektimes! Я не знаю удивлю ли тебя я или нет, но сегодня мы будем выделять ДНК. В сети много информации о том, как в домашних условия выделить нуклеиновые кислоты из клеток человека и не только человека. Большинство из этих гайдов похожи на рецепт пирога, описывающих последовательность добавления ингредиентов в тесто. В этой публикации я хочу показать не просто рецепт, а попытаться объяснить что и зачем нужно в этом пироге. В конце концов механизмы получения нуклеиновых кислот что в лаборатории, что дома одни и те же.
Читать полностью »
Роскомнадзор отрицает свою причастность к проблемам с доступом к сервису Vimeo
2015-04-02 в 7:17, admin, рубрики: vimeo, блокировки, регулирование интернета, РНК, РоскомнадзорВчера, 1 апреля, в сети появилась информация о том, что популярный видеохостинг Vimeo был вновь заблокирован Роскомнадзором. Причиной для подобных выводов послужила ситуация четырехмесячной давности, когда РНК по требованию прокуратуры РФ ограничил доступ к страницам с пропагандистскими роликами двух террористических организаций: ИГИЛ и «Пламя Войны».
Однако, сегодня, в официальной группе РоскомнадзораЧитать полностью »
RNAInSpace и фолдинг тРНК — закрытие сезона, новый сезон — Структурное выравнивание
2014-07-21 в 23:02, admin, рубрики: биоинформатика, геном, РНК, Структурное выравнивание, фолдингИ вот не прошло и полтора года как я добрался собрать третичную структуру тРНК. Напомню, что ранее писал статью на эту тему на хабре Развитие RNAInSpace… . Надо сказать, что около года я этим не занимался, но за это время вышла вторая моя научная статья на эту тему Применение теории игр для задачи сворачивания рибонуклеиновых кислот (это для тех кто захочет поговорить об этом профессионально). Но вот недавно я можно сказать получил третичную структуру тРНК и сверил её с образцом имеющимся в базе данных (PDB), который получен биологическими методами (кристалография).
Под катом рисунки 3D-структуры тРНК, пояснения и планы на будущие…
О молекулах РНК
2013-07-25 в 9:46, admin, рубрики: Brainfuck, биология, Биотехнологии, РНК, химия, метки: brainfuck, биология, биотехнологии, РНК, химияО рибонуклеиновых кислотах (РНК)
Для поддержания жизни в живом организме происходит множество процессов. Некоторые из них мы можем наблюдать — дыхание, прием пищи, избавление от продуктов жизнедеятельности, получение информации органами чувств и забывание этой информации. Но большая часть химических процессов скрыта от глаз.
Читать полностью »
Стэнфордские учёные создали компьютер внутри живой клетки
2013-03-31 в 16:19, admin, рубрики: биоинформатика, биологический компьютер, Биотехнологии, будущее здесь, днк, логические элементы, РНК, метки: биологический компьютер, днк, логические элементы, РНК 
В XIX веке Чарльз Бэббидж, разрабатывая проект своей вычислительной машины, опирался на механические элементы. ЭНИАК, первая современная универсальная ЭВМ, созданная в середине 40-ых, была основана на особенностях работы вакуумных ламп. Сегодня компьютеры используют транзисторы на основе полупроводниковых элементов для проведения логических операций.
Команда биоинженеров Стэнфордском университете в свою очередь создала логический элемент из генетического материала, который получил название биологический транзистор или транскриптор. Об этом они сообщили в журнале Science 28 марта этого года.
В публикации исследователи описали универсальную систему генетических транзисторов, которая может быть помещена в живую клетку и быть включена или отключена при определенных условиях. Авторы исследования высказывают надежду, что со временем такие группы транзисторов могут стать микроскопическими живыми компьютерами. Компьютеры такого рода могут выполнять разнообразные задачи, к примеру, определять наличие определенного токсина в клетке, считать количество делений раковой клетки или предоставлять детальную и точную информацию о взаимодейтсвии препарата на какой-либо вид клеток.
Читать полностью »
Получена траектория сворачивания вироидного рибозима или новости с фронтов при использовании ПО RNAInSpace
2012-08-12 в 3:28, admin, рубрики: Алгоритмы, биоинформатика, кибернетика, разработка, РНК, фолдинг, метки: кибернетика, РНК, фолдингПару месяцев назад я рассказывал о приближенных результатах в задаче о сворачивании РНК. Напомню требуется свернуть вироидный рибозим NC_003540 организма Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, третичная структура которого неизвестна.
И вот оно свершилось — рибозим свернулся !
Смотрим его конечное состояние, а под катом еще его траекторию сворачивания, а также подводим итоги.