Куда только не заводили поиски идеального гуя для MySQL под Linux :)
Мой личный рейтинг пока выглядит так:
- HeidiSQL под вайном
- Valentina Studio
- MySQL Workbench
Web-based решения особо не интересовали по ряду причин. Но недавно наткнулся на проект DbNinja, и стало интересно. Что оно умеет можно посмотреть на страницах проекта, например, тут. Кому-то хватит, кому-то мало, но я о том, как избавиться от браузера, и открывать ЭТО в отдельном окошке, без лишних рюшек и бантиков.