Биоинформатик Андрей Афанасьев — один из основателей биотехстартапа yRisk. В интервью Андрей рассказал, какие технологии они используют, чтобы определить, есть ли у человека предрасположенность к наследственным формам рака, как дела с биотехнологиями в России и есть ли в биотехе работа для программистов.
Рубрика «генетика» - 4
Как российский биотехстартап помогает бороться с раком
2019-12-25 в 10:09, admin, рубрики: Биотехнологии, Блог компании Человек наук, будущее здесь, генетика, Научно-популярное, Программирование
Задача №2. Определение популяционной структуры
2019-12-20 в 13:35, admin, рубрики: big data, биоинформатика, Биотехнологии, Блог компании «Атлас», генетика, генетическое программирование, гены, днк, ДНК человека, днк-тесты, Здоровье гика, Научно-популярное, происхождение человекаМы продолжаем цикл задач, где рассказыаем, как работать с генетическими данными. Первую задачу «Узнайте пол и степень родства» уже можно решить и прислать нам ответы. Сегодня публикуем вторую.
Главный приз — Полный геном.
Что расскажет «жвачка» возрастом 5700 лет о человеке, который ее жевал?
2019-12-20 в 8:00, admin, рубрики: археология, Биотехнологии, Блог компании ua-hosting.company, генетика, геном, днк, древний человек, жвачка, Здоровье гика, микробиота, микробы, Научно-популярное, Читальный зал
В детективных сериалах и фильмах, где криминалисты играют главную роль двигателя сюжета, частенько можно встретить, как по окурку от сигареты или по жвачке, прилепленной к столу, успешно определялся человек, оставивший эти следы. В реальной же жизни из жвачки, побывавшей во рту человека, также можно о нем много узнать. Сегодня мы с вами рассмотрим исследование, в котором ученые из Копенгагенского университета обнаружили во время раскопок «жвачку», возраст которой составляет примерно 5700 лет. Какую информацию о человеке смогли получить ученые из своей находки, о ком еще смогла рассказать древняя жвачка и как данное исследование может повлиять на борьбу с различными заболеваниями в будущем? Ответы на эти вопросы ждут нас в докладе ученых. Поехали.Читать полностью »
Задача №1. Узнайте пол и степень родства
2019-12-18 в 12:38, admin, рубрики: анализ данных, биоинформатика, биоинформатические алгоритмы, Биотехнологии, Блог компании «Атлас», генетика, генетика человека, гены, задачи для программистов, Здоровье гика, Научно-популярноеВ предыдущей подробной статье про Полный геном мы обещали опубликовать три задачи и подарить тест тому, кто первым решит все три правильно. Заодно в этих задачах мы даем примеры, как можно работать с генетическими данными. Сегодня публикуем первую.
Что такое Полный геном и зачем он нужен
2019-12-13 в 12:39, admin, рубрики: биоинформатика, Биотехнологии, Блог компании «Атлас», генетика, генетический анализ, генетический код, гены, днк, Здоровье гика, здоровье и компьютер, здоровье и образ жизни, Научно-популярное, профилактика заболеваний, секвенирование генома, секвенирование ДНКАтлас запустил новый продукт — Полный геном. Теперь мы можем исследовать не только отдельные точки в геноме, как в генетическом тесте, но и прочитать всю последовательность нуклеотидов генома. В этой статье рассказываем, что это и зачем это нужно.
Внимание! Мы подарим Полный геном одному из наших читателей, кто выполнит все задания. Подробнее — в конце статьи.
Эпигенетические часы старения — а всё-таки, они тикают!…
2019-11-25 в 2:19, admin, рубрики: бельмонте, биология, Биотехнологии, борьба со старением, генетика, гены, Здоровье гика, Научно-популярное, трансгуманизм, факторы яманаки, часы метилирования, эпигенетика, эпигенетические часы, эпигенетический откат, эпиоткат, эпичасы, яманака
Что такое эпигенетические часы я когда-то уже писал. Если вкратце, на сегодняшний день это лучший показатель биовозраста, который точнее паспорта отражает, сколько нам осталось жить. Почему эпичасы так важны? Потому что я считаю, что старение — это эпигенетическая программа. Кто-то называет это моё убеждение религиозным. Да без проблем, готов считать этот тезис своим «Символом веры». Ну или «Символом Юры» — верую, что старение есмь эпигенетическая программа и чаю её взлом.
Ведь верую я в это не просто так, а на основании всего уместившегося на сегодняшний день в моей голове массива данных. В котором особое место отведено тем самым эпигенетическим часам метилирования. Особое оно из-за того, что с возрастом у млекопитающих метилирование ДНК не просто стохастически «вымывается», как можно было бы предположить при случайной природе этого процесса, а часто наоборот усиливается, что обычно коррелирует со снижением экспрессии различных нужных генов (нужных, потому что если бы они не были нужными, они были бы выключены изначально, хотя бы после полового созревания, а не плавно выключались по мере старения).
Вообще наблюдения возрастного снижения экспрессии нужных генов всплывают в сфере изучения биологических механизмов старения постоянно. Чуть дальше я вернусь к этой теме и приведу несколько работ, показавших такое снижение у разных видов.
При этом наблюдается и обратный процесс: некоторые совсем ненужные нам гены, такие как вредоносные ретротраспозоны, в раннем возрасте не просто выключены, а находятся за семью печатями, но к определённому моменту печати почему-то распечатываются и эта «пятая колонна» начинает свою активность, подвергая бомбардировке наши гены своими копиями. Это приводит к гиперактивации врождённого иммунитета, то есть к пресловутому «инфламэйджингу» — стерильному возрастному воспалению, — которое поголовно наблюдается у пожилых людей и животных.
Читать полностью »
Биология для программистов: как инженерный подход меняет мир
2019-11-20 в 9:56, admin, рубрики: биология, биопрограммирование, биотех, Биотехнологии, Блог компании Mail.Ru Group, будущее здесь, генетика, генная инженерия, Здоровье гика, Научно-популярное
Партнеры венчурного фонда Andreessen Horowitz, эксперты в области инвестиций в биотех Хорхе Конде, Виджай Панде и Джули Ю написали манифест о роли инженерных принципов для создания инноваций в биологии, основные мысли из которого легли в основу этого поста.
Человечество находится на пороге перехода биологии от эмпирической науки к инженерной дисциплине. На протяжении тысячелетий для воздействия на живые системы применялись техногенные подходы, сейчас же мы начали использовать собственные механизмы природы — с помощью биологической инженерии — для проектирования, масштабирования и преобразования самой жизни.
Гипотеза, проверка, пересмотр данных — это эмпирическая наука. Инжиниринг, однако, работает не совсем так: вы используете детали, которые хорошо знаете и понимаете, для проектирования и создания чего-либо, например софта. Мы хорошо умеем писать программы — отчасти потому, что начали делать их с нуля. Тем не менее идея перенести инженерное мышление в биологию, эволюционирующую миллиарды лет без участия человека, хорошо прижилась.
Читать полностью »
Генетика любви: межполовой конфликт как основа сотрудничества в парах моногамных птиц
2019-10-18 в 7:00, admin, рубрики: биология, Блог компании ua-hosting.company, генетика, генетические алгоритмы, Научно-популярное, партнерство, потомство, продолжение рода, птицы, размножение, спаривание, Читальный зал, эволюция, экология
Отношения между партнерами, наполненные заботой, знаками внимания и сопереживанием, поэты называют любовью, а вот биологи — межполовой взаимосвязью, нацеленной на выживание и продолжение рода. Одни виды предпочитают брать количеством — размножаться с как можно большим числом партнеров, чтобы увеличить потомство, тем самым повысив шансы на выживание всего вида. Другие же создают моногамные пары, которые могут прекратить свое существование лишь после смерти одного из партнеров. Многие годы ученые считали, что первый вариант значительно выгоднее, но это не совсем так. Моногамные пары, как правило, совместно воспитывают потомство, т.е. защищают его от хищников, добывают пищу и учат определенным навыкам, тогда как в полигамных отношениях все это чаще всего ложится на хрупкие плечи самок. Конечно, бывают исключения, но сегодня не о них. Биологов долгое время интересовал другой занятный момент — самцы продолжают проявлять знаки внимания в адрес самок, даже когда их пара уже сформирована и существует несколько лет. Чем обусловлено такое поведение, какая от этого выгода и какие эволюционные аспекты с этим связаны? На эти вопросы мы найдем ответы в докладе исследовательской группы. Поехали.Читать полностью »
CRISPR дает возможность избавить человека от боли
2019-08-25 в 20:45, admin, рубрики: CRISPR, Биотехнологии, Блог компании Madrobots, боль, будущее здесь, генетика, днк, Медгаджеты
В течение нескольких лет CRISPR верой и правдой служит генетикам, которые при помощи этой технологии смогли достичь новых высот в редактировании генома животных и изучении ДНК человека. Сейчас ученые разрабатывают новую технологию, которая, по всей видимости, сможет отключать боль у тех, кто в этом нуждается.
Люди, которые не чувствуют боли, встречаются очень редко, о них было известно задолго до наступления XXI века. Как выяснилось, у них есть определенная мутация, которая блокирует ген, отвечающий за боль. В частности, такой ген отсутствовал у бродячего артиста из Пакистана — мальчика, выступавшего на улицах с удивительными номерами. Он вонзал ножи в свои ладони и ходил по раскаленным углям без малейших признаков боли.
Читать полностью »
Исследователи установили, что размер заработка наполовину определяется генетикой
2019-05-28 в 13:30, admin, рубрики: генетика, наследственность, Научно-популярное
Недавнее исследование группы финских ученых-социологов показало, что наследственность оказывает существенное влияние на уровень заработка. Согласно полученным данным, для женщин генетические особенности определяют трудовой доход на 40%, для мужчин же — более чем на 50%.
Читать полностью »