Актуальность тренировки.
Рубрика «филогенетика»
Биоинформатика на минималках. Почему блохи родственники ледничков?
2021-01-17 в 11:29, admin, рубрики: Биотехнологии, блоха, Научно-популярное, родственные связи, филогенетикаDistant Joining: выбираем репрезентативный набор генов
2018-03-16 в 9:18, admin, рубрики: python, биоинформатика, выборка данных, Программирование, филогенетикаСовременные методы биоинформатики позволяют довольно точно восстанавливать эволюционные истории на основании последовательностей генов или белков ныне живущих организмов. А благодаря технологиям секвенирования нового поколения последовательности производятся быстрее, чем их успевают анализировать. Вот только эволюционная реконструкция – дело вычислительно дорогое и неплохо бы уметь получать репрезентативные выборки пригодного для анализа размера. Как это сделать и что вообще такое в данном случае “репрезентативная” – под катом.
Читать полностью »
Как реконструируют ход эволюции?
2015-03-17 в 18:37, admin, рубрики: биоинформатика, Биотехнологии, Научно-популярное, филогенетика, эволюцияХод эволюции изображают в виде деревьев
Важнейшей задачей биологии является реконструкция хода эволюции. Данных палеонтологии катострофически не хватает, а все, что у нас есть кроме нее, это ныне живые организмы. Пути эволюции изображают в виде деревьев жизни, или филогентических деревьев, показывающих, в каком порядке разошлись эволюционные пути различных организмов. Филогенетическими они называются потому, что процесс эволюционной истории организма называется филогенезом.
Сейчас деревья имеют множество важных применений, как чисто фундаментального характера. Например, чтобы узнать особенности строения организмов, живших миллиарды лет назад. Они используются при сборках геномов, поиске генов, важных для патогенности возбудителей болезней, и многого другого.
Читать полностью »