Электронные микроскопы хороши для получения изображений с высоким разрешением атомной структуры материала — при условии, что материал твердый. К сожалению, электронное излучение может разрушать более мягкие вещества, так что ученым приходится использовать излучение рентгеновское. Увы, рентгеновские микроскопы не могут достичь атомарного разрешения, так что с их помощью нельзя сфотографировать атомы.