Привет! Меня зовут Александр Телепов, я — исследователь в Институте AIRI. Наша команда занимается применением глубокого обучения в науках о жизни. В сферу наших интересов входят такие задачи, как дизайн материалов, анализ растворимости или поиск новых лекарственных препаратов. Про последнее я бы хотел поговорить поподробнее.
О том, что сегодня для поиска новых соединений используют нейросети, слышали многие. Взять хотя бы нашумевший AlphaFold 3Читать полностью »
Модель 5-HT3-рецептора. A.J.Thompson//Trends in Pharmacological Sciences, 2013, Vol. 34, p. 100-109.
Часть 1.
Часть 2.
Прежде чем продолжить, я бы хотел сказать, что тему предсказания биологической активности химических соединений до меня поднимали a00 и odevinyak. Вот ссылки на их сообщения:
https://geektimes.ru/post/191864/
https://geektimes.ru/post/142602/
С точки зрения drug design наиболее интересными представляются ответы на следующие вопросы:
— проявляет ли соединение Х биологическую активность в отношении мишени Y, и каким образом можно улучшить эту активность;
— к каким мишеням в принципе может проявлять активность соединение Х.
Несмотря на то, что сходные по своей сути задачи требуют несколько разных подходов, все они основаны на одном важном абстрактном понятии. Мне всё время хочется определить его так, как никто ещё в мире не делал (через геометрическое место точек) но пока не получается. Может, это сумеет сделать кто-нибудь из вас (правда, у меня есть сомнения в том, что это возможно)?
Читать полностью »
